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Survival and viability of cells from iron depositing bacterial strains in pretests for the EXPOSE-R2-Experiment

Feyh, N. und de Vera, Jean Pierre Paul und Szewzyk, U. (2014) Survival and viability of cells from iron depositing bacterial strains in pretests for the EXPOSE-R2-Experiment. EANA 2014, 2014-10-13 - 2014-10-16, Edinburgh, UK.

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Offizielle URL: http://www.astrobiology.ac.uk/files/2013/03/Abstract-Book-EANA.pdf

Kurzfassung

Five environmental isolates (Pseudomonas sp. BS1, Hyphomonas sp. BS2, Tetrasphaera sp. FL1, Pedomicrobium sp. FL6 and Leptothrix sp. OT_B_406) were chosen for EXPOSE-R2 including pretests (EVT1/2, SVT) due to their ability to form Fe(III)-oxyhydroxide-containing biofilms as observed for natural communities of iron depositing bacteria. Samples were produced by drying iron-containing cell aggregates on Mars regolith simulant mixtures (S-/P-MRS) (Böttger et al., 2012). Different Mars- and Space-relevant treatments were applied during EVT1/2 and SVT: artificial atmosphere, vacuum, UV-C irradiation and temperatures from -25 °C to 60 °C. Viability of cells was determined afterwards by recultivation and Fluorescence in-situ hybridization (FISH). In order to estimate membrane integrity, cell staining was applied as standalone-method and in combination with subsequent qPCR (PMA-qPCR) (Nocker et al., 2008). Strains FL1 and FL6 were found to be recultivable from most of the samples. FISH-positive cells were detected in all sample types. PMA-qPCR was found to be superior to classic LIVE-DEAD staining due to being more sensitive. Culture independent techniques like FISH and qPCR can help to make more precise estimates about survival of microorganisms by detecting viable but not culturable cells.

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/94146/
Dokumentart:Konferenzbeitrag (Poster)
Titel:Survival and viability of cells from iron depositing bacterial strains in pretests for the EXPOSE-R2-Experiment
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Feyh, N.Institut für Umwelttechnologie, TU BerlinNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
de Vera, Jean Pierre Pauljean-pierre.devera (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Szewzyk, U.Institut für Umwelttechnologie, TU BerlinNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Datum:13 Oktober 2014
Referierte Publikation:Nein
Open Access:Ja
Gold Open Access:Nein
In SCOPUS:Nein
In ISI Web of Science:Nein
Status:veröffentlicht
Stichwörter:iron bacteria; EXPOSE-R2; space experiments; survival; viability
Veranstaltungstitel:EANA 2014
Veranstaltungsort:Edinburgh, UK
Veranstaltungsart:internationale Konferenz
Veranstaltungsbeginn:13 Oktober 2014
Veranstaltungsende:16 Oktober 2014
Veranstalter :UK Centre of Astrobiology
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HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Erforschung des Weltraums
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R EW - Erforschung des Weltraums
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - Exploration des Sonnensystems
Standort: Berlin-Adlershof
Institute & Einrichtungen:Institut für Planetenforschung > Experimentelle Planetenphysik
Hinterlegt von: de Vera, Dr. Jean Pierre Paul
Hinterlegt am:06 Jan 2015 14:44
Letzte Änderung:24 Apr 2024 20:00

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