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Rank reordering for MPI communication optimization

Brandfass, Barbara und Thomas, Alrutz und Thomas, Gerhold (2013) Rank reordering for MPI communication optimization. Computers & Fluids, Vol. 80, Seiten 372-380. Elsevier. doi: 10.1016/j.compfluid.2012.01.019. ISSN 0045-7930.

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Offizielle URL: http://dx.doi.org/10.1016/j.compfluid.2012.01.019

Kurzfassung

In this paper we describe a procedure for optimizing the MPI communication of an unstructured CFD code in a parallel multi-core environment. By reordering the MPI ranks, a mapping of MPI processes to CPU cores is established, such that the main communication takes place within the compute nodes. The motivation of this approach is based on the observation that the communication between CPU cores on the same compute node is usually much faster than the communication between CPU cores on different nodes. The generic nature of our approach provides an out-of-the-box optimization tool, which can be easily used with other CFD codes due to the external MPI rank reordering procedure. The optimization tool was successfully tested with the DLR TAU code and the results of the optimization are demonstrated by benchmark computations for different geometries of aircraft configurations.

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/75095/
Dokumentart:Zeitschriftenbeitrag
Zusätzliche Informationen:Available online: 31 January 2012
Titel:Rank reordering for MPI communication optimization
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Brandfass, Barbarabarbara.brandfass (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Thomas, AlrutzT-Systems Solutions for Research GmbHNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Thomas, GerholdNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Datum:2013
Erschienen in:Computers & Fluids
Referierte Publikation:Ja
Open Access:Nein
Gold Open Access:Nein
In SCOPUS:Ja
In ISI Web of Science:Ja
Band:Vol. 80
DOI:10.1016/j.compfluid.2012.01.019
Seitenbereich:Seiten 372-380
Verlag:Elsevier
ISSN:0045-7930
Status:veröffentlicht
Stichwörter:Parallelization, Domain decomposition, Computational Fluid Dynamics, MPI rank reordering
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Luftfahrt
HGF - Programmthema:Starrflügler (alt)
DLR - Schwerpunkt:Luftfahrt
DLR - Forschungsgebiet:L AR - Starrflüglerforschung
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):L - Simulation & Validierung (alt)
Standort: Göttingen
Institute & Einrichtungen:Institut für Aerodynamik und Strömungstechnik > C²A²S²E - Center for Computer Applications in AeroSpace Science and Engineering
Hinterlegt von: Brandfass, Barbara
Hinterlegt am:10 Dez 2012 10:25
Letzte Änderung:07 Nov 2023 08:20

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