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Automated Strategies To Identify Compounds on the Basis of GC/EI-MS and Calculated Properties

Schymanski, Emma L und Meringer, Markus und Brack, Werner (2011) Automated Strategies To Identify Compounds on the Basis of GC/EI-MS and Calculated Properties. Analytical Chemistry, 83 (3), Seiten 903-912. American Chemical society (ACS). DOI: 10.1021/ac102574h ISSN 0003-2700

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Offizielle URL: http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ac102574h


The identification of unknown compounds based on GC/EI-MS spectrum and structure generation techniques has been improved by combining a number of strategies into a programmed sequence. The program MOLGEN-MS is used to determine the molecular formula and incorporate substructural information to generate all structures matching the mass spectral information. Mass spectral fragments are then predicted for each structure and compared with the experimental spectrum using a match value. Additional data are then calculated automatically for each candidate to allow exclusion of candidates that did not match other analytical information. The effectiveness of these “exclusion criteria”, as well as the programming sequence, was tested using a case study of 29 isomers of formula C12H10O2. The default classifier precision resulted in the generation of too many structures in some cases, which was improved by up to several orders of magnitude by including additional classifiers or restrictions. Combining this with the exclusion of candidates based on a Lee retention index/boiling point correlation, octanol−water partitioning coefficients, steric energies, and finally spectral match values limited the number of candidate structures further from over 1 billion without any restrictions down to less than 6 structures in 10 cases and below 35 in all but 3 cases. This method can be used in the absence of matching database spectra and brings unknown identification based on MS interpretation and structure generation techniques a step closer to practical reality.

Titel:Automated Strategies To Identify Compounds on the Basis of GC/EI-MS and Calculated Properties
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iD
Schymanski, Emma LHelmholtz-Zentrum für Umweltforschung (UFZ)NICHT SPEZIFIZIERT
Meringer, MarkusInstitut für Methodik der Fernerkundung (IMF), Deutsches Zentrum für Luft- und Raumfahrt (DLR)NICHT SPEZIFIZIERT
Brack, WernerHelmholtz-Zentrum für Umweltforschung (UFZ)NICHT SPEZIFIZIERT
Datum:1 Februar 2011
Erschienen in:Analytical Chemistry
Referierte Publikation:Ja
In Open Access:Nein
In ISI Web of Science:Ja
DOI :10.1021/ac102574h
Seitenbereich:Seiten 903-912
HerausgeberInstitution und/oder E-Mail-Adresse der Herausgeber
Verlag:American Chemical society (ACS)
Stichwörter:Mass Spectrometry, Constitutional Isomers, Structure Generation, Calculated Properties
HGF - Forschungsbereich:keine Zuordnung
HGF - Programm:keine Zuordnung
HGF - Programmthema:keine Zuordnung
DLR - Schwerpunkt:keine Zuordnung
DLR - Forschungsgebiet:keine Zuordnung
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):keine Zuordnung
Standort: Oberpfaffenhofen
Institute & Einrichtungen:Institut für Methodik der Fernerkundung > Atmosphärenprozessoren
Hinterlegt von: Meringer, Dr.rer.nat. Markus
Hinterlegt am:25 Feb 2011 10:20
Letzte Änderung:08 Mär 2018 18:46

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