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MEmilio v1.1.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn software

Kühn, Martin Joachim und Abele, Daniel und Kerkmann, David und Korf, Sascha Alexander und Zunker, Henrik und Wendler, Anna Clara und Bicker, Julia und Nguyen, Khoa und Schmieding, Rene und Plötzke, Lena und Lenz, Patrick und Betz, Maximilian Franz und Gerstein, Carlotta und Schmidt, Agatha und Johannssen, Paul und Klitz, Margrit und Koslow, Wadim und Binder, Sebastian und Siggel, Martin und Kleinert, Jan und Rack, Kathrin und Lutz, Annette und Meyer-Hermann, Michael (2024) MEmilio v1.1.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn software. [sonstige Veröffentlichung]

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Offizielle URL: https://doi.org/10.5281/zenodo.10796356

Kurzfassung

v1.1.0 Changes

Added features / functionality:

Graph simulation with metapopulation model for Munich Computation of reproduction number for ODE SECIR model Machine learnt surrogate model for ODE SECIR model with multiple age groups and contact change points Linear Chain Trick SECIR model New initialization for IDE model Unit Tests with OpenMP

Corrections:

Correct selection of specialized simulation and advance functions in python bindings Corrections for new MSVC

Other:

Expanded tests for python bindings simulations Small changes and fixes (logo, pull request template, ...)

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/209608/
Dokumentart:sonstige Veröffentlichung
Titel:MEmilio v1.1.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn software
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Kühn, Martin JoachimMartin.Kuehn (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-0906-6984NICHT SPEZIFIZIERT
Abele, DanielDaniel.Abele (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0001-7021-1573172669419
Kerkmann, Daviddavidchristian.kerkmann (at) helmholtz-hzi.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Korf, Sascha AlexanderSascha.Korf (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-1431-3046NICHT SPEZIFIZIERT
Zunker, Henrikhenrik.zunker (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-9825-365X172669421
Wendler, Anna Claraanna.wendler (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-1816-8907NICHT SPEZIFIZIERT
Bicker, Juliajulia.bicker (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0001-9382-4209NICHT SPEZIFIZIERT
Nguyen, KhoaHelmholtz Centre for Infection ResearchNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Schmieding, ReneRene.Schmieding (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-2769-0270NICHT SPEZIFIZIERT
Plötzke, LenaLena.Ploetzke (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0003-0440-1429172669422
Lenz, Patrickpatrick.lenz (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Betz, Maximilian FranzMaximilian.Betz (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Gerstein, Carlottacarlotta.gerstein (at) dlr.dehttps://orcid.org/0009-0004-4410-0502NICHT SPEZIFIZIERT
Schmidt, AgathaAgatha.Schmidt (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Johannssen, Paulpaul.johannssen (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Klitz, MargritDeutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungenhttps://orcid.org/0000-0003-3657-4180NICHT SPEZIFIZIERT
Koslow, WadimWadim.Koslow (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Binder, SebastianDepartment of Systems Immunology and Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS), Helmholtz Centre for Infection Researchhttps://orcid.org/0000-0003-1169-1786NICHT SPEZIFIZIERT
Siggel, Martinmartin.siggel (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-3952-4659NICHT SPEZIFIZIERT
Kleinert, JanJan.Kleinert (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-2709-214X172669424
Rack, KathrinKathrin.Rack (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-5794-5705172669426
Lutz, AnnetteAnnette.Lutz (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Meyer-Hermann, MichaelDepartment of Systems Immunology and Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS), Helmholtz Centre for Infection Researchhttps://orcid.org/0000-0002-4300-2474NICHT SPEZIFIZIERT
Datum:8 März 2024
Erschienen in:zenodo
Referierte Publikation:Nein
Open Access:Nein
DOI:10.5281/zenodo.10796356
Status:veröffentlicht
Stichwörter:Scientific computing, mathematical modeling, software framework, High-performance computing, infectious diseases, agent-based modeling, metapopulation models, mobility
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Technik für Raumfahrtsysteme
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R SY - Technik für Raumfahrtsysteme
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - Aufgaben SISTEC
Standort: Köln-Porz
Institute & Einrichtungen:Institut für Softwaretechnologie
Institut für Softwaretechnologie > High-Performance Computing
Hinterlegt von: Kühn, Dr. Martin Joachim
Hinterlegt am:28 Nov 2024 09:47
Letzte Änderung:04 Nov 2025 10:41

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