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MEmilio v1.0.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn software

Kühn, Martin Joachim und Abele, Daniel und Kerkmann, David und Korf, Sascha Alexander und Zunker, Henrik und Wendler, Anna Clara und Bicker, Julia und Nguyen, Dang Khoa und Schmieding, René und Plötzke, Lena und Lenz, Patrick und Betz, Maximilian Franz und Gerstein, Carlotta und Schmidt, Agatha und Johannssen, Paul und Klitz, Margrit und Binder, Sebastian und Siggel, Martin und Koslow, Wadim und Kleinert, Jan und Rack, Kathrin und Lutz, Annette und Meyer-Hermann, Michael (2023) MEmilio v1.0.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn software. [sonstige Veröffentlichung]

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Offizielle URL: https://github.com/DLR-SC/memilio

Kurzfassung

MEmilio implements various models for infectious disease dynamics, from simple compartmental (ODE) models through Integro-Differential equation-based (IDE) models (sometimes also denoted "age of infection models") to agent- or individual-based models (ABMs). Its modular design allows the combination of different models with different mobility patterns. Through efficient implementation and parallelization, MEmilio brings cutting edge and compute intensive epidemiological models to a large scale, enabling a precise and high-resolution spatiotemporal infectious disease dynamics.

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/201659/
Dokumentart:sonstige Veröffentlichung
Titel:MEmilio v1.0.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn software
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Kühn, Martin JoachimMartin.Kuehn (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-0906-6984NICHT SPEZIFIZIERT
Abele, DanielDaniel.Abele (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0001-7021-1573149900572
Kerkmann, Daviddavidchristian.kerkmann (at) helmholtz-hzi.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Korf, Sascha AlexanderSascha.Korf (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-1431-3046NICHT SPEZIFIZIERT
Zunker, Henrikhenrik.zunker (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-9825-365X149900574
Wendler, Anna Claraanna.wendler (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-1816-8907NICHT SPEZIFIZIERT
Bicker, Juliajulia.bicker (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0001-9382-4209NICHT SPEZIFIZIERT
Nguyen, Dang Khoakhoa.nguyen (at) helmholtz-hzi.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Schmieding, Renérene.schmieding (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-2769-0270NICHT SPEZIFIZIERT
Plötzke, LenaLena.Ploetzke (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0003-0440-1429149900575
Lenz, PatrickPatrick.Lenz (at) DLR.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Betz, Maximilian FranzMaximilian.Betz (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Gerstein, Carlottacarlotta.gerstein (at) DLR.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Schmidt, AgathaAgatha.Schmidt (at) DLR.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Johannssen, Paulpaul.johannssen (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Klitz, MargritDeutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungenhttps://orcid.org/0000-0003-3657-4180NICHT SPEZIFIZIERT
Binder, SebastianDepartment of Systems Immunology and Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS), Helmholtz Centre for Infection Researchhttps://orcid.org/0000-0003-1169-1786NICHT SPEZIFIZIERT
Siggel, Martinmartin.siggel (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-3952-4659NICHT SPEZIFIZIERT
Koslow, WadimWadim.Koslow (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Kleinert, JanJan.Kleinert (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-2709-214X149900577
Rack, KathrinKathrin.Rack (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-5794-5705149900580
Lutz, Annetteannette-lutz (at) gmx.netNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Meyer-Hermann, MichaelDepartment of Systems Immunology and Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS), Helmholtz Centre for Infection Researchhttps://orcid.org/0000-0002-4300-2474NICHT SPEZIFIZIERT
Datum:20 Dezember 2023
Erschienen in:Zenodo: https://zenodo.org/records/10412635
Referierte Publikation:Nein
Open Access:Nein
Gold Open Access:Nein
In SCOPUS:Nein
In ISI Web of Science:Nein
DOI:10.5281/zenodo.10412635
Status:veröffentlicht
Stichwörter:Epidemics, Epidemiology, Computer simulation, Mathematical modeling, Virus, Sars-CoV-2, Covid-19, Pandemic Preparedness, High Performance Computing, Computer science
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Technik für Raumfahrtsysteme
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R SY - Technik für Raumfahrtsysteme
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - Aufgaben SISTEC
Standort: Köln-Porz
Institute & Einrichtungen:Institut für Softwaretechnologie > High-Performance Computing
Institut für Softwaretechnologie
Hinterlegt von: Kühn, Dr. Martin Joachim
Hinterlegt am:04 Jan 2024 08:31
Letzte Änderung:04 Jan 2024 08:31

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