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Metagenome-Assembled Genomes of Komagataeibacter from Kombucha Exposed to Mars-Like Conditions Reveal the Secrets in Tolerating Extraterrestrial Stresses

Lee, Imchang und Podolich, Olga und Brenig, Bertram und Tiwari, Sandeep und Azevedo, Vasco und De Carvalho, Daniel Santana und Trovatti Uetanabaro, Ana Paula und Góes-Neto, Aristóteles und Alzahrani, Kalid J. und Reva, Oleg und Kozyrovsdka, Natalia und de Vera, Jean Pierre Paul und Barh, Debmalya und Kim, Bong-Soo (2022) Metagenome-Assembled Genomes of Komagataeibacter from Kombucha Exposed to Mars-Like Conditions Reveal the Secrets in Tolerating Extraterrestrial Stresses. Journal of Microbiology and Biotechnology, 32 (8), Seiten 967-975. Springer Nature. doi: 10.4014/jmb.2204.04009. ISSN 1017-7825.

[img] PDF - Verlagsversion (veröffentlichte Fassung)
4MB

Kurzfassung

Kombucha mutualistic community (KMC) is composed by acetic acid bacteria and yeasts, producing fermented tea with health benefits. As part of the BIOlogy and Mars EXperiment (BIOMEX) project, the effect of Mars-like conditions on the KMC was analyzed. Here, we analyzed metagenomeassembled genomes (MAGs) of the Komagataeibacter, which is a predominant genus in KMC, to understand their roles in the KMC after exposure to Mars-like conditions (outside the International Space Station) based on functional genetic elements. We constructed three MAGs: K. hansenii, K.rhaeticus, and K. oboediens. Our results showed that (i) K. oboediens MAG functionally more complex than K. hansenii, (ii) K. hansenii is a keystone in KMCs with specific functional features to tolerate extreme stress, and (iii) genes related to the PPDK, betaine biosynthesis, polyamines biosynthesis, sulfate-sulfur assimilation pathway as well as type II toxin-antitoxin (TA) system, quorum sensing (QS) system, and cellulose production could play important roles in the resilience of KMC after exposure to Mars-like stress. Our findings show the potential mechanisms through which Komagataeibacter tolerates the extraterrestrial stress and will help to understand minimal microbial composition of KMC for space travelers.

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/188070/
Dokumentart:Zeitschriftenbeitrag
Titel:Metagenome-Assembled Genomes of Komagataeibacter from Kombucha Exposed to Mars-Like Conditions Reveal the Secrets in Tolerating Extraterrestrial Stresses
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Lee, ImchangHallym Univeristy KoreaNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Podolich, OlgaInstitute of Molecular Biology and Genetics of NASU, Kyiv, Ukraine.NICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Brenig, BertramIns. of Veterinary Medicine, University GöttingenNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Tiwari, SandeepLab. de Genetica Celular e Molecular, Dep. de Biologia Geral, Instituto de Ciencias Biologicas. Univ. de Minas Gerais, BrazilNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Azevedo, VascoInstitute of Biological Sciences, Federal University of Minas Gerais, Belo HorizonteNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
De Carvalho, Daniel SantanaInstitute of Biological Sciences, Federal University of Minas Gerais, Belo HorizonteNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Trovatti Uetanabaro, Ana PaulaLaboratory of Molecular and Computational Biology of Fungi, Department of Microbiology, Department of Genetics, Ecology and Evolution, Institute of Biological Sciences, Federal University of Minas Gerais, Belo Horizonte, BrazilNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Góes-Neto, AristótelesInstitute of Biological Sciences, Federal University of Minas Gerais, Belo Horizonte, BrazilNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Alzahrani, Kalid J.Department of Clinical Laboratories Sciences, College of Applied Medical Sciences, Taif University, Saudi ArabiaNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Reva, OlegDepartment of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Centre for Bioinformatics and Computational Biology, University of Pretoria, Pretoria, South Africa.NICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Kozyrovsdka, NataliaInstitute of Molecular Biology and Genetics of NASU, Kyiv, UkraineNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
de Vera, Jean Pierre Pauljean-pierre.devera (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Barh, DebmalyaDepartamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, BrazilNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Kim, Bong-SooHallym University KoreaNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Datum:7 Juli 2022
Erschienen in:Journal of Microbiology and Biotechnology
Referierte Publikation:Ja
Open Access:Ja
Gold Open Access:Nein
In SCOPUS:Ja
In ISI Web of Science:Ja
Band:32
DOI:10.4014/jmb.2204.04009
Seitenbereich:Seiten 967-975
Verlag:Springer Nature
ISSN:1017-7825
Status:veröffentlicht
Stichwörter:Kombucha, Komagataeibacter, metagenome assembled genome, mars-like condition, whole metagenome
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Erforschung des Weltraums
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R EW - Erforschung des Weltraums
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - BioSigN (BioSignatures and habitabile Niches)
Standort: Köln-Porz
Institute & Einrichtungen:Raumflugbetrieb und Astronautentraining > Nutzerzentrum für Weltraumexperimente (MUSC)
Hinterlegt von: Herrmann, Astrid
Hinterlegt am:06 Sep 2022 09:43
Letzte Änderung:06 Sep 2022 09:43

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