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Molecular response of Deinococcus radiodurans to simulated microgravity explored by proteometabolomic approach

Ott, Emanuel und Fuchs, Felix M. und Moeller, Ralf und Hemmersbach, Ruth und Kawaguchi, Yuko und Yamagishi, Akihiko und Weckwerth, Wolfram und Milojevic, Tetyana (2019) Molecular response of Deinococcus radiodurans to simulated microgravity explored by proteometabolomic approach. Scientific Reports, 9 (1), Seite 18462. Nature Publishing Group. doi: 10.1038/s41598-019-54742-6. ISSN 2045-2322.

[img] PDF - Verlagsversion (veröffentlichte Fassung)
2MB

Offizielle URL: http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-54742-6

Kurzfassung

Regarding future space exploration missions and long-term exposure experiments, a detailed investigation of all factors present in the outer space environment and their effects on organisms of all life kingdoms is advantageous. Influenced by the multiple factors of outer space, the extremophilic bacterium Deinococcus radiodurans has been long-termly exposed outside the international Space Station in frames of the tanpopo orbital mission. the study presented here aims to elucidate molecular key components in D. radiodurans, which are responsible for recognition and adaptation to simulated microgravity. D. radiodurans cultures were grown for two days on plates in a fast-rotating 2-D clinostat to minimize sedimentation, thus simulating reduced gravity conditions. Subsequently, metabolites and proteins were extracted and measured with mass spectrometry-based techniques. our results emphasize the importance of certain signal transducer proteins, which showed higher abundances in cells grown under reduced gravity. these proteins activate a cellular signal cascade, which leads to differences in gene expressions. Proteins involved in stress response, repair mechanisms and proteins connected to the extracellular milieu and the cell envelope showed an increased abundance under simulated microgravity. focusing on the expression of these proteins might present a strategy of cells to adapt to microgravity conditions.

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/134232/
Dokumentart:Zeitschriftenbeitrag
Titel:Molecular response of Deinococcus radiodurans to simulated microgravity explored by proteometabolomic approach
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Ott, EmanuelExtremophiles/Space Biochemistry Group, Department of Biophysical Chemistry, University of Vienna, Vienna, AustriaNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Fuchs, Felix M.Radiation Biology Department, Institute of Aerospace Medicine, German Aerospace Center (DLR), Cologne, Germany; felix.fuchs (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0001-5669-5655NICHT SPEZIFIZIERT
Moeller, RalfRadiation Biology Department, Institute of Aerospace Medicine, German Aerospace Center (DLR), Cologne, Germany; ralf.moeller (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-2371-0676NICHT SPEZIFIZIERT
Hemmersbach, RuthGerman Aerospace Center (DLR e.V.), Institute of Aerospace Medicine, Gravitational Biology, Cologne (Köln), Germanyhttps://orcid.org/0000-0001-5308-6715NICHT SPEZIFIZIERT
Kawaguchi, YukoPlanetary Exploration Research Centre (PERC), Chiba Institute of Technology (CIT), Chiba, JapanNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Yamagishi, AkihikoDepartment of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology, Nagatsuta, Yokohama, JapanNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Weckwerth, WolframDepartment of Ecogenomics and Systems Biology, University of Vienna, Vienna, Austria and Vienna Metabolomics Centre (VIME), University of Vienna, Vienna, AustriaNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Milojevic, TetyanaExtremophiles/Space Biochemistry Group, Department of Biophysical Chemistry, University of Vienna, Vienna, AustriaNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Datum:5 Dezember 2019
Erschienen in:Scientific Reports
Referierte Publikation:Ja
Open Access:Ja
Gold Open Access:Ja
In SCOPUS:Ja
In ISI Web of Science:Ja
Band:9
DOI:10.1038/s41598-019-54742-6
Seitenbereich:Seite 18462
Verlag:Nature Publishing Group
ISSN:2045-2322
Status:veröffentlicht
Stichwörter:Molecular Response, Deinococcus radiodurans, simulated microgravity
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Forschung unter Weltraumbedingungen
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R FR - Forschung unter Weltraumbedingungen
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - Vorhaben Strahlenbiologie (alt)
Standort: Köln-Porz
Institute & Einrichtungen:Institut für Luft- und Raumfahrtmedizin > Gravitationsbiologie
Institut für Luft- und Raumfahrtmedizin > Strahlenbiologie
Hinterlegt von: Kopp, Kerstin
Hinterlegt am:03 Mär 2020 12:50
Letzte Änderung:29 Sep 2020 17:17

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