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Microbial Markers Profile in Anaerobic Mars Analogue Environments Using the LDChip (Life Detector Chip) Antibody Microarray Core of the SOLID (Signs of Life Detector) Platform

García-Descalzo, Laura und Parro, Victorino und García-Villadangos, Miriam und Cockell, Charles S. und Moissl-Eichinger, Christine und Perras, Alex und Rettberg, Petra und Beblo-Vranesevic, Kristina und Bohmeier, Maria und Rabbow, Elke und Westall, Frances und Gaboyer, Frederik und Amils, Ricardo und Malki, Moustafa und Marteinsson, Viggo und Vannier, Pauline und Ehrenfreund, Pascale und Monaghan, Euan und Riedo, Andreas und Cabezas, Patricia und Walter, Nicolas und Gómez, Felipe Gómez (2019) Microbial Markers Profile in Anaerobic Mars Analogue Environments Using the LDChip (Life Detector Chip) Antibody Microarray Core of the SOLID (Signs of Life Detector) Platform. Microorganisms, 7 (9), Seite 365. Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI). doi: 10.3390/microorganisms7090365. ISSN 2076-2607.

[img] PDF - Verlagsversion (veröffentlichte Fassung)
2MB

Offizielle URL: http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms7090365

Kurzfassung

One of the main objectives for astrobiology is to unravel and explore the habitability of environments beyond Earth, paying special attention to Mars. If the combined environmental stress factors on Mars are compatible with life or if they were less harsh in the past, to investigate the traces of past or present life is critical to understand its potential habitability. Essential for this research is the characterization of Mars analogue environments on Earth through the development of techniques for biomarker detection in them. Biosensing techniques based on fluorescence sandwich microarray immunoassays (FSMI) have shown to be a powerful tool to detect biosignatures and depict the microbial profiles of different environments. In this study, we described the microbial biomarker profile of five anoxic Mars analogues sites using the Life Detector Chip (LDChip), an antibody microarray for multiple microbial marker detection. Furthermore, we contributed to new targets by developing a new 26-polyclonal antibodies microarray using crude extracts from anaerobic sampling sites, halophilic microorganisms, and anaerobic isolates obtained in the framework of the European Mars Analogues for Space Exploration (MASE) project. The new subset of antibodies was characterized and implemented into a microarray platform (MASE-Chip) for microbial marker searching in salty and anaerobic environments.

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/129247/
Dokumentart:Zeitschriftenbeitrag
Titel:Microbial Markers Profile in Anaerobic Mars Analogue Environments Using the LDChip (Life Detector Chip) Antibody Microarray Core of the SOLID (Signs of Life Detector) Platform
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
García-Descalzo, LauraCentro de Astrobiología (CSIC-INTA), 28850 Madrid, Spain; garciadl (at) cab.inta-csic.esNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Parro, VictorinoCentro de Astrobiología (CSIC-INTA), 28850 Madrid, Spain; parrov (at) cab.inta-csic.esNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
García-Villadangos, MiriamCentro de Astrobiología (CSIC-INTA), 28850 Madrid, Spain; villadangosgm (at) cab.inta-csic.esNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Cockell, Charles S.UK Center for Astrobiology, School of Physics and Astronomy, University of Edinburgh, Edinburgh EH9 3FD, UK; c.s.cockell (at) ed.ac.ukhttps://orcid.org/0000-0003-3662-0503NICHT SPEZIFIZIERT
Moissl-Eichinger, ChristineDepartment of Internal Medicine, Medical University of Graz, 8036 Graz, Austria and BioTechMed Graz, 8010 Graz, Austria; christine.moissl-eichinger (at) medunigraz.atNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Perras, AlexDepartment of Internal Medicine, Medical University of Graz, 8036 Graz, Austria and Department of Microbiology and Archaea, University of Regensburg, 93040 Regensburg, Germany; akperras (at) gmail.comNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Rettberg, PetraRadiation Biology Department, Institute of Aerospace Medicine, German Aerospace Center (DLR), Cologne, Germany; petra.rettberg (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0003-4439-2395NICHT SPEZIFIZIERT
Beblo-Vranesevic, KristinaRadiation Biology Department, Institute of Aerospace Medicine, German Aerospace Center (DLR), Cologne, Germany; kristina.beblo (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-4834-7121NICHT SPEZIFIZIERT
Bohmeier, MariaRadiation Biology Department, Institute of Aerospace Medicine, German Aerospace Center (DLR), Cologne, Germany; Maria.Bohmeier (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Rabbow, ElkeRadiation Biology Department, Institute of Aerospace Medicine, German Aerospace Center (DLR), Cologne, Germany; Elke.Rabbow (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-9301-2021NICHT SPEZIFIZIERT
Westall, FrancesCentre de Biophysique Moléculaire, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), 45100 Orléans, France; frances.westall (at) cnrs-orleans.frNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Gaboyer, FrederikCentre de Biophysique Moléculaire, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), 45100 Orléans, France; frederic.gaboyer (at) cnrs-orleans.frNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Amils, RicardoCentro de Biología Molecular Severo Ochoa (CSIC-UAM), 28049 Madrid, Spain and Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CSIC-UAM), 28049 Madrid, Spain; mkasma (at) hotmail.comNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Malki, MoustafaCentro de Biología Molecular Severo Ochoa (CSIC-UAM), 28049 Madrid, Spain; mkasma (at) hotmail.comNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Marteinsson, ViggoMATIS-Prokaria, 113 Reykjavík, Iceland and Faculty of Food Science and Nutrition, University of Iceland, 101 Reykjavík, Iceland; viggo (at) matis.isNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Vannier, PaulineMATIS-Prokaria, 113 Reykjavík, Iceland; pauline.vannier (at) matis.isNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Ehrenfreund, PascaleLeiden Observatory, Universiteit Leiden, 2300 Leiden, The Netherlands; p.ehrenfreund (at) chem.leidenuniv.nlNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Monaghan, EuanLeiden Observatory, Universiteit Leiden, 2300 Leiden, The Netherlands; monaghan (at) strw.leidenuniv.nlNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Riedo, AndreasLeiden Observatory, Universiteit Leiden, 2300 Leiden, The Netherlands; riedo (at) strw.leidenuniv.nlNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Cabezas, PatriciaEuropean Science Foundation (ESF), 67080 Strasbourg, France; PCabezas (at) esf.orgNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Walter, NicolasEuropean Science Foundation (ESF), 67080 Strasbourg, France; nwalter (at) esf.orgNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Gómez, Felipe GómezCentro de Astrobiología (CSIC-INTA), 28850 Madrid, Spain; gomezgf (at) cab.inta-csic.esNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Datum:18 September 2019
Erschienen in:Microorganisms
Referierte Publikation:Ja
Open Access:Ja
Gold Open Access:Ja
In SCOPUS:Ja
In ISI Web of Science:Ja
Band:7
DOI:10.3390/microorganisms7090365
Seitenbereich:Seite 365
Verlag:Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
ISSN:2076-2607
Status:veröffentlicht
Stichwörter:anaerobic environments; Mars; analogues; biomarkers; microarray
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Forschung unter Weltraumbedingungen
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R FR - Forschung unter Weltraumbedingungen
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - Vorhaben Strahlenbiologie (alt)
Standort: Köln-Porz
Institute & Einrichtungen:Institut für Luft- und Raumfahrtmedizin > Strahlenbiologie
Hinterlegt von: Kopp, Kerstin
Hinterlegt am:20 Sep 2019 11:35
Letzte Änderung:14 Okt 2020 04:17

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