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MEmilio v2.0.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn software

Bicker, Julia und Kerkmann, David und Korf, Sascha Alexander und Plötzke, Lena und Schmieding, Rene und Wendler, Anna Clara und Zunker, Henrik und Nguyen, Khoa und Abele, Daniel und Gerstein, Carlotta und Lenz, Patrick und Betz, Maximilian Franz und Schmidt, Agatha und Hannemann-Tamas, Ralf und Volmer, Kilian und Waßmuth, Nils und Richter, Daniel und Tritzschak, Hannah und Basermann, Achim und Meyer-Hermann, Michael und Hasenauer, Jan und Kühn, Martin Joachim (2025) MEmilio v2.0.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn software. [sonstige Veröffentlichung]

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Offizielle URL: https://doi.org/10.5281/zenodo.15168968

Kurzfassung

MEmilio implements various models for infectious disease dynamics, from simple compartmental (ODE) models through Integro-Differential equation-based (IDE) models (sometimes also denoted "age of infection models") to agent- or individual-based models (ABMs). Its modular design allows the combination of different models with different mobility patterns. Through efficient implementation and parallelization, MEmilio brings cutting edge and compute intensive epidemiological models to a large scale, enabling a precise and high-resolution spatiotemporal infectious disease dynamics.

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/213614/
Dokumentart:sonstige Veröffentlichung
Titel:MEmilio v2.0.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn software
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Bicker, Juliajulia.bicker (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0001-9382-4209NICHT SPEZIFIZIERT
Kerkmann, Daviddavidchristian.kerkmann (at) helmholtz-hzi.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Korf, Sascha AlexanderSascha.Korf (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-1431-3046NICHT SPEZIFIZIERT
Plötzke, LenaLena.Ploetzke (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0003-0440-1429182196064
Schmieding, ReneRene.Schmieding (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-2769-0270NICHT SPEZIFIZIERT
Wendler, Anna Claraanna.wendler (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-1816-8907NICHT SPEZIFIZIERT
Zunker, Henrikhenrik.zunker (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-9825-365X182196066
Nguyen, KhoaHelmholtz Centre for Infection ResearchNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Abele, DanielDaniel.Abele (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0001-7021-1573182196067
Gerstein, Carlottacarlotta.gerstein (at) uni-bonn.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Lenz, Patrickpatrick.lenz (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Betz, Maximilian FranzMaximilian.Betz (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Schmidt, AgathaAgatha.Schmidt (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Hannemann-Tamas, RalfForschungszentrum JülichNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Volmer, Kiliankilian.volmer (at) uni-bonn.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Waßmuth, NilsNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Richter, Danieldaniel.richter (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Tritzschak, HannahHannah.Tritzschak (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Basermann, AchimAchim.Basermann (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0003-3637-3231182196068
Meyer-Hermann, MichaelDepartment of Systems Immunology and Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS), Helmholtz Centre for Infection ResearchNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Hasenauer, Janjan.hasenauer (at) uni-bonn.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Kühn, Martin JoachimMartin.Kuehn (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-0906-6984NICHT SPEZIFIZIERT
Datum:7 April 2025
Erschienen in:zenodo
Referierte Publikation:Nein
Open Access:Nein
DOI:10.5281/zenodo.15168968
Status:veröffentlicht
Stichwörter:Scientific computing, mathematical modeling, software framework, High-performance computing, infectious diseases, agent-based modeling, metapopulation models, mobility
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Technik für Raumfahrtsysteme
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R SY - Technik für Raumfahrtsysteme
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - Aufgaben SISTEC
Standort: Köln-Porz
Institute & Einrichtungen:Institut für Softwaretechnologie
Institut für Softwaretechnologie > High-Performance Computing
Hinterlegt von: Kühn, Dr. Martin Joachim
Hinterlegt am:14 Apr 2025 12:30
Letzte Änderung:14 Apr 2025 12:30

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