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Non-random genetic alterations in the cyanobacterium Nostoc sp. exposed to space conditions

Liu, Yuguang und Jeraldo, Patricio und Herbert, Wiliam und McDonough, Samantha und Eckloff, Bruce und de Vera, Jean Pierre Paul und Cockell, C. und Leya, Thomas und Baqué, Mickael und Jen, Jin und Schulze-Makuch, Dirk und Walther-Antonio, Marina (2022) Non-random genetic alterations in the cyanobacterium Nostoc sp. exposed to space conditions. Scientific Reports, 12 (12580). Nature Publishing Group. doi: 10.1038/s41598-022-16789-w. ISSN 2045-2322.

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Kurzfassung

Understanding the impact of long-term exposure of microorganisms to space is critical in understanding how these exposures impact the evolution and adaptation of microbial life under space conditions. In this work we subjected Nostoc sp. CCCryo 231-06, a cyanobacterium capable of living under many diferent ecological conditions, and also surviving in extreme ones, to a 23-month stay at the International Space Station (the Biology and Mars Experiment, BIOMEX, on the EXPOSE-R2 platform) and returned it to Earth for single-cell genome analysis. We used microfuidic technology and single cell sequencing to identify the changes that occurred in the whole genome of single Nostoc cells. The variant profle showed that bioflm and photosystem associated loci were the most altered, with an increased variant rate of synonymous base pair substitutions. The cause(s) of these non random alterations and their implications to the evolutionary potential of single bacterial cells under long-term cosmic exposure warrants further investigation.

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/187641/
Dokumentart:Zeitschriftenbeitrag
Titel:Non-random genetic alterations in the cyanobacterium Nostoc sp. exposed to space conditions
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Liu, YuguangDivison of Surgical Research, Dep. of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, USANICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Jeraldo, PatricioDivison of Surgical Research, Dep. of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, USANICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Herbert, WiliamMicrobiome Program, Center for Individualized Medicine, Mayo Clinik, Rochester, USANICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
McDonough, SamanthaMedical Genome Facility, Center for Individualized Medicine, Mayo Clinic, Rochester, USANICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Eckloff, BruceMedical Genome Facility, Center for Individualized Medicine, Mayo Clinic, Rochester, USANICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
de Vera, Jean Pierre Pauljean-pierre.devera (at) dlr.deNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Cockell, C.UK Center for Astrobiology, School of Physics and Astronomy, Univer-sity of Edinburgh, Edinburgh, United KingdomNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Leya, ThomasExtremophile Research and Biobank CCCryo, Branch Bioanalytics and Bioprocesses (IZI‐BB), Fraunhofer Institute for Cell Therapy and Immunology, Potsdam, GermanyNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Baqué, MickaelMickael.Baque (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0002-6696-6030NICHT SPEZIFIZIERT
Jen, JinMedical Genome Facility, Center for Individualized Medicine, Mayo Clinic, Rochester, USANICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Schulze-Makuch, DirkAstrobiology Group, Center of Astronomy and Astrophysics, TU Berlin, GermanyNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Walther-Antonio, MarinaDivision of Surgical Research, Dep. of Surgery, Mayo Clinic, Rochester, USANICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Datum:22 Juli 2022
Erschienen in:Scientific Reports
Referierte Publikation:Ja
Open Access:Ja
Gold Open Access:Ja
In SCOPUS:Ja
In ISI Web of Science:Ja
Band:12
DOI:10.1038/s41598-022-16789-w
Herausgeber:
HerausgeberInstitution und/oder E-Mail-Adresse der HerausgeberHerausgeber-ORCID-iDORCID Put Code
Springer, NatureNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERTNICHT SPEZIFIZIERT
Verlag:Nature Publishing Group
Name der Reihe:nature portfolio
ISSN:2045-2322
Status:veröffentlicht
Stichwörter:cyanobaterium, space conditions
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Erforschung des Weltraums
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R EW - Erforschung des Weltraums
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - Planetary Evolution and Life
Standort: Berlin-Adlershof , Köln-Porz
Institute & Einrichtungen:Raumflugbetrieb und Astronautentraining > Nutzerzentrum für Weltraumexperimente (MUSC)
Institut für Planetenforschung > Planetare Labore
Hinterlegt von: Herrmann, Astrid
Hinterlegt am:25 Jul 2022 10:49
Letzte Änderung:11 Jan 2023 14:22

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