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Algorithms for Chemical Space Enumeration and Applications in Astrobiology

Meringer, Markus (2020) Algorithms for Chemical Space Enumeration and Applications in Astrobiology. Small Organic Molecules Workshop, 2020-03-24, Oxford, UK.

[img] PDF
5MB

Offizielle URL: https://www.stats.ox.ac.uk/events/small-organic-molecules-workshop/

Kurzfassung

From its very beginnings the development of algorithms for the enumeration of chemical space was closely related to NASA's early exobiology activities. The complete and non-redundant generation of all connectivity isomers corresponding to a given molecular formula was part of the DENDRAL program, established in the mid-1960s. In the 1970s mathematicians provided new techniques to increase efficiency of the first approaches, and starting with the 1990s implementations became available as software packages for customary computers. In this talk some of the most essential principles of exhaustive and non-redundant structure enumeration are reviewed: starting from simple labeled graphs we will see how to avoid isomorphic duplicates, introduce structural constraints and how to generate molecular graphs in an efficient way. Recently these methods have been rediscovered for application in astrobiology and origins of life research, particularly for generating and analyzing virtual chemical compound libraries surrounding the most important biomolecules. Results concerning the genetically encoded amino acid alphabet, nucleotide analogs and the core of intermediary metabolism are summarized.

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/133900/
Dokumentart:Konferenzbeitrag (Vortrag)
Titel:Algorithms for Chemical Space Enumeration and Applications in Astrobiology
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Meringer, MarkusMarkus.Meringer (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0001-8526-2429NICHT SPEZIFIZIERT
Datum:24 März 2020
Referierte Publikation:Nein
Open Access:Ja
Gold Open Access:Nein
In SCOPUS:Nein
In ISI Web of Science:Nein
Status:veröffentlicht
Stichwörter:chemical space, structure generation algorithms, virtual libraries, amino acids, nucleotide analogs, intermediary metabolism, origins of life, astrobiology
Veranstaltungstitel:Small Organic Molecules Workshop
Veranstaltungsort:Oxford, UK
Veranstaltungsart:Workshop
Veranstaltungsdatum:24 März 2020
Veranstalter :Department of Statistics, University of Oxford
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Erforschung des Weltraums
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R EW - Erforschung des Weltraums
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - Explorationsstudien (alt)
Standort: Oberpfaffenhofen
Institute & Einrichtungen:Institut für Methodik der Fernerkundung > Atmosphärenprozessoren
Hinterlegt von: Meringer, Dr.rer.nat. Markus
Hinterlegt am:30 Jan 2020 12:20
Letzte Änderung:24 Apr 2024 20:37

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