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Reproducible Science with Python

Schreiber, Andreas (2016) Reproducible Science with Python. PyCon DE 2016, 2016-10-29 - 2016-10-30, München, Deutschland. (nicht veröffentlicht)

[img] PDF (Vortrag)
8MB

Offizielle URL: http://www.pymunich.com/talks/29-10-2016/reproducible-science-with-python

Kurzfassung

In science, results that are not reproducible by peer scientists are valueless and of no significance. Good practices for reproducible science are to publish used codes under Open Source licenses, perform code reviews, save the computational environments with containers (e.g., Docker), use open data formats, use a data management system, and record the provenance of all actions. This talk shows how to record the provenance of code development, code execution, and data management using a standard format for provenance and accompanying Python libraries. In particular, how to gather the provenance of an development process based on Git, how to gather provenance of any Python script and of any IPython/Jupyter notebook, and how to gather provenance of a paper written in LaTeX. Finally, the talk shows how use Python to analyze and explore the provenance, which is stored in a graph database (Neo4J).

elib-URL des Eintrags:https://elib.dlr.de/110542/
Dokumentart:Konferenzbeitrag (Vortrag)
Titel:Reproducible Science with Python
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-AdresseAutoren-ORCID-iDORCID Put Code
Schreiber, AndreasAndreas.Schreiber (at) dlr.dehttps://orcid.org/0000-0001-5750-5649NICHT SPEZIFIZIERT
Datum:29 Oktober 2016
Referierte Publikation:Nein
Open Access:Ja
Gold Open Access:Nein
In SCOPUS:Nein
In ISI Web of Science:Nein
Status:nicht veröffentlicht
Stichwörter:Data science, provenance, reproducibility, reproducible science, graph databases, neo4j, python
Veranstaltungstitel:PyCon DE 2016
Veranstaltungsort:München, Deutschland
Veranstaltungsart:internationale Konferenz
Veranstaltungsbeginn:29 Oktober 2016
Veranstaltungsende:30 Oktober 2016
Veranstalter :PyMunich
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:Technik für Raumfahrtsysteme
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R SY - Technik für Raumfahrtsysteme
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R - Vorhaben SISTEC (alt)
Standort: Köln-Porz
Institute & Einrichtungen:Institut für Simulations- und Softwaretechnik > Verteilte Systeme und Komponentensoftware
Institut für Simulations- und Softwaretechnik
Hinterlegt von: Schreiber, Andreas
Hinterlegt am:11 Jan 2017 14:19
Letzte Änderung:24 Apr 2024 20:15

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