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MS/MS Data Improves Automated Determination of Molecular Formulas by Mass Spectrometry

Meringer, Markus und Reinker, S und Zhang, J und Muller, A (2011) MS/MS Data Improves Automated Determination of Molecular Formulas by Mass Spectrometry. MATCH Communications in Mathematical and in Computer Chemistry, 65 (2), Seiten 259-290. ISSN 0340-6253.

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Offizielle URL: http://www.pmf.kg.ac.rs/match/electronic_versions/match65/n2/match65(2)_259-290.pdf

Kurzfassung

In theory, the molecular formula of an unknown compound can be calculated from its exact molecular mass. However, even with highly accurate modern mass spectrometers with an accuracy of 1 ppm or lower, it is generally not possible to determine the molecular formula uniquely from measurements. Intensities of isotopic peaks are typically used as additional information to narrow down possible formulas associated with a mass spectrum (MS) peak, but this is not sufficient for larger compounds. Here, we introduce a method that takes information from fragment peak masses of the MS/MS into account to improve the reliability of formula determination. Matchvalues that reflect the consistency with MS isotope peaks and MS/MS fragment patterns are computed for candidate molecular formulas. We demonstrate that these matchvalues outperform methods based on isotope peak intensities alone. In test cases with medium sized organic molecules (< 1000 u) the true molecular formula achieves the highest matchvalues using the MS/MS data.

Dokumentart:Zeitschriftenbeitrag
Titel:MS/MS Data Improves Automated Determination of Molecular Formulas by Mass Spectrometry
Autoren:
AutorenInstitution oder E-Mail-Adresse der Autoren
Meringer, MarkusDeutsches Zentrum für Luft- und Raumfahrt (DLR)
Reinker, SNovartis Institutes for BioMedical Research (NIBR)
Zhang, JNovartis Institutes for BioMedical Research (NIBR)
Muller, ANovartis Institutes for BioMedical Research (NIBR)
Datum:2011
Erschienen in:MATCH Communications in Mathematical and in Computer Chemistry
Referierte Publikation:Ja
In Open Access:Nein
In SCOPUS:Ja
In ISI Web of Science:Ja
Band:65
Seitenbereich:Seiten 259-290
Herausgeber:
HerausgeberInstitution und/oder E-Mail-Adresse der Herausgeber
Gutman, INICHT SPEZIFIZIERT
ISSN:0340-6253
Status:veröffentlicht
Stichwörter:Tandem MS, Orbitrap, Structure Elucidation, Algorithm, Biomarker, Natural Product
HGF - Forschungsbereich:Luftfahrt, Raumfahrt und Verkehr
HGF - Programm:Raumfahrt
HGF - Programmthema:keine Zuordnung
DLR - Schwerpunkt:Raumfahrt
DLR - Forschungsgebiet:R - keine Zuordnung
DLR - Teilgebiet (Projekt, Vorhaben):R -- keine Zuordnung
Standort: Oberpfaffenhofen
Institute & Einrichtungen:Institut für Methodik der Fernerkundung > Atmosphärenprozessoren
Hinterlegt von: Dr.rer.nat. Markus Meringer
Hinterlegt am:28 Nov 2011 07:23
Letzte Änderung:05 Mär 2013 11:33

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